Fermentation submergée de Streptomyces uncialis fournissant une plate-forme biotechnologique pour la biosynthèse, l’ingénierie et la production de l’incialamycine

L’oncialamycine (UCM) appartient à la sous-famille fusionnée à l’anthraquinone des produits naturels enediyne à 10 membres qui présente une cytotoxicité extraordinaire contre un large spectre de lignées cellulaires cancéreuses humaines. Les conjugués anticorps-médicament (ADC), utilisant des analogues synthétiques de l’UCM comme charge utile, sont en développement préclinique. L’UCM est exclusivement produit par Streptomyces uncialis DCA2648 sur milieu gélose solide à faibles titres (∼0,019 mg / L), limitant son apport par fermentation microbienne et entravant ses études de biosynthèse et d’ingénierie par la manipulation des voies in vivo.

Nous rapportons ici les conditions de culture qui permettent la manipulation génétique de la biosynthèse UCM in vivo et permettent la production d’UCM, avec des titres améliorés, par fermentation submergée des souches de S. uncialis modifiées. Ces résultats mettent en évidence une plate-forme biotechnologique pour la biosynthèse, l’ingénierie et la production d’UCM qui devrait faciliter à la fois ses études fondamentales et ses applications translationnelles.

Plus précisément, le titre d’UCM a été amélioré de près de 58 fois à ∼1,1 mg / L grâce à la combinaison de la suppression de grappes de gènes biosynthétiques codant pour des métabolites non liés du type sauvage de S. uncialis, la mutagenèse chimique et la manipulation de régulateurs spécifiques de la voie pour les souches de S. uncialis, et enfin l’optimisation moyenne de ces dernières pour la production d’UCM. La manipulation génétique de la biosynthèse de l’UCM a été démontrée en inactivant des gènes sélectionnés dans les souches modifiées de S. uncialis, dont l’une a donné une souche mutante accumulant la tiancimycine B, un intermédiaire biosynthétique commun connu pour la sous-famille de produits naturels d’énediyne fusionnés à l’anthraquinone.

Applications de la bioluminescence en biotechnologie et au-delà

La bioluminescence est le phénomène naturel fascinant par lequel les créatures vivantes produisent de la lumière. La bioluminescence se produit lorsque l’oxydation d’une luciférine à petite molécule est catalysée par une enzyme luciférase pour former une espèce à l’état excité qui émet de la lumière. Il existe plus de 30 systèmes bioluminescents connus, mais les paires luciférine-luciférase de seulement 11 systèmes ont été caractérisées à ce jour, tandis que d’autres nouveaux systèmes sont actuellement à l’étude. Les différentes paires luciférine-luciférase ont des longueurs d’onde d’émission de lumière différentes et sont donc adaptées à diverses applications.

La dernière décennie environ a vu de grands progrès dans l’ingénierie des protéines, la chimie synthétique et la physique qui ont permis aux luciférines et aux luciférases d’atteindre des applications jusqu’alors inexplorées. La réaction de bioluminescence est désormais couramment utilisée pour les dosages géniques, la détection des interactions protéine-protéine, le criblage à haut débit (HTS) dans la découverte de médicaments, le contrôle de l’hygiène, l’analyse de la pollution dans les écosystèmes et l’imagerie in vivo chez les petits mammifères. S’éloignant de la détection et de l’imagerie, les faits saillants les plus récents des applications de la bioluminescence en biomédecine comprennent le photodécage induit par la bioluminescence de petites molécules

la thérapie photodynamique basée sur la bioluminescence (PDT) et l’utilisation de la bioluminescence pour contrôler les neurones. Il y a également eu une augmentation de la recherche sur le ciel bleu telle que l’ingénierie de diverses usines émettrices de lumière. Cela a conduit à de nombreuses sciences multidisciplinaires passionnantes dans diverses disciplines. Cette revue se concentre sur les applications passées, présentes et futures de la bioluminescence. Nous visons à rendre cette revue accessible à tous les chimistes pour comprendre comment ces applications ont été développées et sur quoi elles reposent, en termes simples et compréhensibles pour un chimiste diplômé.

Les informations génomiques ont révélé que la capacité exceptionnelle de synthèse de produits naturels par A. terreus reste à explorer davantage. Avec les progrès de la stratégie d’extraction du génome, les produits de plusieurs grappes de gènes biosynthétiques cryptiques ont été découverts récemment. En outre, une série d’études d’ingénierie métabolique ont été réalisées dans les souches industrielles de lovastatine et d’acide itaconique pour améliorer encore les processus de production. Cette revue présente les progrès actuels et les perspectives d’avenir dans le domaine de la biotechnologie A. terreus.

Une caractérisation multi-omique du stress thermique dans une souche de Scenedesmus halotolérante pour la biotechnologie algale

Les microalgues convertissent efficacement la lumière du soleil en lipides et en glucides, offrant des alternatives biosourcées pour la production d’énergie et de produits chimiques. L’amélioration de la productivité et de la robustesse des algues contre le stress abiotique nécessite une caractérisation au niveau des systèmes permise par la génomique fonctionnelle. Ici, nous caractérisons une microalgue halotolérante Scenedesmus sp. NREL 46B-D3 démontrant un pic de croissance près de 25 ° C qui atteint 30 g / m2 / jour et la plus grande capacité d’accumulation de biomasse après la division cellulaire rapportée à ce jour pour une souche halotolérante.

SafePinky DNA Gel Staining Solution
S1000-200	GenDepot	4X500ml	EUR 280

SDS-PAGE Resolving Gel Casting Solution
P9050-050	GenDepot	500ml	EUR 88

SDS-PAGE Resolving Gel Casting Solution
P9050-100	GenDepot	2X500ml	EUR 120

SDS-PAGE Stacking Gel Casting Solution
P9051-010	GenDepot	100ml	EUR 80

SDS-PAGE Stacking Gel Casting Solution
P9051-050	GenDepot	500ml	EUR 112

T-Pro EZ Gel Solution 8%
JB02-B008M	T-Pro Biotechnology	500ml/BT	EUR 222

T-Pro EZ Gel Solution 8%
JB02-B008S	T-Pro Biotechnology	100ml/BT	EUR 135

T-Pro EZ Gel Solution 10%
JB02-B010M	T-Pro Biotechnology	500ml/BT	EUR 222

T-Pro EZ Gel Solution 10%
JB02-B010S	T-Pro Biotechnology	100ml/BT	EUR 135

T-Pro EZ Gel Solution 12%
JB02-B012M	T-Pro Biotechnology	500ml/BT	EUR 222

T-Pro EZ Gel Solution 12%
JB02-B012S	T-Pro Biotechnology	100ml/BT	EUR 135

T-Pro EZ Gel Solution 15%
JB02-B015M	T-Pro Biotechnology	500ml/BT	EUR 222

T-Pro EZ Gel Solution 15%
JB02-B015S	T-Pro Biotechnology	100ml/BT	EUR 135

T-Pro EZ stain Gel solution
JT90-R005M	T-Pro Biotechnology	500ml/BT	EUR 187

T-Pro EZ stain Gel solution
JT90-R005S	T-Pro Biotechnology	100ml/BT	EUR 126

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(10%)
F1500-100	GenDepot	2x500ml	EUR 188

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(8%)
F1501-100	GenDepot	2X500ml	EUR 188

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(12.5%)
F1502-100	GenDepot	2X500ml	EUR 188

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(15%)
F1503-100	GenDepot	2X500ml	EUR 188

dsGreen Gel Staining Solution, 10000×, 0.5 mL
10010	Lumiprobe	0.5 mL	EUR 89

dsGreen Gel Staining Solution, 10000×, 1 mL
20010	Lumiprobe	1 mL	EUR 134

dsGreen Gel Staining Solution, 10000×, 50 uL
A0010	Lumiprobe	50 uL	EUR 52

SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water
S1001-025	GenDepot	250ul	EUR 161

SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water
S1001-050	GenDepot	2x250ul	EUR 247

SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water
S1001-100	GenDepot	1ml	EUR 435

SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water
S1001-500	GenDepot	5x1ml	EUR 1643

Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x)
S1002-001	GenDepot	1ml	EUR 111

Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x)
S1002-005	GenDepot	5x1ml	EUR 226

Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x)
S1002-010	GenDepot	10ml	EUR 300

Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x)
S1002-020	GenDepot	20ml	EUR 496

Conjugate Drying Buffer, 2 mL
CDB-002	BioAssayWorks	2 mL	EUR 88.51
Description: Conjugate Drying Buffer nables drying of gold conjugates on ribbon or conjugate pad suitable for lateral-flow assay.

Cyber Orange™ Nucleic Acid Gel Stain *10,000X DMSO Solution*
17595	AAT Bioquest	1 ml	EUR 306

Gelite™ Red Nucleic Acid Gel Stain *10,000X DMSO Solution*
17600	AAT Bioquest	1 mL	EUR 176

Gelite™ Red Nucleic Acid Gel Stain *100X Water Solution*
17603	AAT Bioquest	10 mL	EUR 132

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(10%), +500ml Finegel Buffer
F1500-000	GenDepot	500ml	EUR 188

Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(8%) + 500ml Finegel Buffer
F1501-000	GenDepot	500ml	EUR 188

Maximo-Gel juice fluorescent Protein-Gel Gel stain
310012	GeneOn	10 ml	EUR 185

Maximo-Gel juice fluorescent Protein-Gel Gel stain
310012-L	GeneOn	10x10ml	EUR 1587

Drying Box, 100 X 40 X 10mm
DB031	Bio Basic	1 UNIT	EUR 76.1

Gel-Bright LED Gel Illuminator
E90003	Biotium	1EA	EUR 773
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1EA

Gel-FAST? Gel Staining/Destaining Kit
K901-40	Biovision		EUR 175

TC Gel
CP048-005	GenDepot	500 g	EUR 232

TC Gel
CP048-010	GenDepot	1 Kg	EUR 347

Gel Tray
2394250	Atto	4unit	EUR 270
Description: I ncl udi ng pl at es

Gel Tray
2398194	Atto	2unit	EUR 354

Gel Cutter
KS071012-11	Biochain	12	EUR 89
Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol.

Gel Filter
KS071012-13	Biochain	12	EUR 115
Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol.

ViSafe RED Gel
S430	GeneOn	500 µl	EUR 146

ViSafe RED Gel
S430L	GeneOn	5x500 µl	EUR 557

ViSafe Green Gel
S435	GeneOn	500 µl	EUR 146

ViSafe Green Gel
S435L	GeneOn	5x500 µl	EUR 557

Ketanserin (Vulketan Gel)
E1KS2232	EnoGene	50mg	EUR 434

Aluminium Phosphate Gel
VAdv-Ly0001	Creative Biolabs	250 mL	EUR 1386
Description: Aluminium Phosphate Gel 2%, Aluminum salt Vaccine adjuvant.

Aluminium Hydroxide Gel
VAdv-Ly0003	Creative Biolabs	250 mL	EUR 1386
Description: Aluminium Hydroxide Gel 2%, Aluminum salt Vaccine adjuvant.

Gel tray L
2322112	Atto	5unit	EUR 257
Description: 2pcs/1set

Gel tray S
2322117	Atto	5unit	EUR 257
Description: 2pcs/1set

AGAR, HIGH GEL
A01-102IHG-10kg	Alphabiosciences	10 kg	EUR 2219

AGAR, HIGH GEL
A01-102IHG-2Kg	Alphabiosciences	2 Kg	EUR 521

AGAR, HIGH GEL
A01-102IHG-500g	Alphabiosciences	500 g	EUR 178

Gel Breaker Tubes
KS071012-12	Biochain	12	EUR 89
Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol.

Sodium Pyruvate Solution, 100 mM Solution
CCM1753-100	Bio Basic	100 mL	EUR 60.84

Stop Solution
F006	Cygnus Technologies	12 ml	EUR 180
Description: Stop Solution by Cygnus Technologies is available in Europe via Gentaur.

DTT Solution
R-1104	EpiGentek	1 ml, 500 mM	EUR 109.45
Description: fast delivery possible

Denaturing solution
DE540	Bio Basic	1L	EUR 61.31

AlphaBioCoat Solution
AC001	Neuromics	20 ml	EUR 271

TRIMMING SOLUTION
99-676-CM	CORNING	1 L /pk	EUR 88
Description: Specialty Media; Islet products

Schiff's Solution
SRF030	ScyTek Laboratories	30 ml	EUR 64

Schiff's Solution
SRF250	ScyTek Laboratories	250 ml	EUR 77

Schiff's Solution
SRF3800	ScyTek Laboratories	1 Gal.	EUR 345

Schiff's Solution
SRF500	ScyTek Laboratories	500 ml	EUR 103

Schiff's Solution
SRF999	ScyTek Laboratories	1000 ml	EUR 149

Tartrazine Solution
TZQ125	ScyTek Laboratories	125 ml	EUR 64

Tartrazine Solution
TZQ500	ScyTek Laboratories	500 ml	EUR 98

Tartrazine Solution
TZQ999	ScyTek Laboratories	1000 ml	EUR 127

Orcein Solution
OAA125	ScyTek Laboratories	125 ml	EUR 66

Orcein Solution
OAA500	ScyTek Laboratories	500 ml	EUR 109

Orcein Solution
OAA999	ScyTek Laboratories	1000 ml	EUR 148

Methenamine Solution
MET125	ScyTek Laboratories	125 ml	EUR 64

Methenamine Solution
MET500	ScyTek Laboratories	500 ml	EUR 95

Methenamine Solution
MET999	ScyTek Laboratories	1000 ml	EUR 132

Borax Solution
BOR015	ScyTek Laboratories	15 ml	EUR 56

Borax Solution
BOR125	ScyTek Laboratories	125 ml	EUR 79

Borax Solution
BOR500	ScyTek Laboratories	500 ml	EUR 119

Borax Solution
BOR999	ScyTek Laboratories	1000 ml	EUR 183

Prehybridization Solution
K2191050-1	Biochain	5 ml	EUR 137
Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation.

Hybridization Solution
K2191050-2	Biochain	5 ml	EUR 157
Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation.

Blocking Solution
K2191050-8	Biochain	250 ul	EUR 137
Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation.

Plug Solution
GR103038	Genorise Scientific	500 mL	EUR 85

SDS Solution
2102-100	Biovision		EUR 137

EDTA Solution
2103-100	Biovision		EUR 137

Gentamicin Solution, Gentamicin Solution, 50 mg/mL
CCM1123-010	Bio Basic	10 mL	EUR 64.05

mini tube gel insert
EVS1100-TUBEINSERT	Consort	ea	EUR 411

maxi tube gel insert
EVS1300-TUBEINSERT	Consort	ea	EUR 504

Gel DNA Recovery Kit
GP05	GeneOn	5 preps	Ask for price

Gel DNA Recovery Kit
GP100	GeneOn	100 preps	EUR 130

Gel DNA Recovery Kit
GP200	GeneOn	200 preps	EUR 189

Gel DNA Recovery Kit
GP50	GeneOn	50 preps	EUR 94

AmbiClean Kit (PCR & Gel)
GV05	GeneOn	5 preps	Ask for price

AmbiClean Kit (PCR & Gel)
GV100	GeneOn	100 preps	EUR 128

AmbiClean Kit (PCR & Gel)
GV200	GeneOn	200 preps	EUR 189

AmbiClean Kit (PCR & Gel)
GV50	GeneOn	50 preps	EUR 91

dam for 15cm gel
EHS3400-DAM	Consort	ea	EUR 158

dam for 20cm gel
EHS3500-DAM	Consort	ea	EUR 166

dam for 23.5cm gel
EHS3600-DAM	Consort	ea	EUR 166

Agar, low gel strength
GK2227-100G	Glentham Life Sciences	100 g	EUR 50

Agar, low gel strength
GK2227-250G	Glentham Life Sciences	250 g	EUR 66

Agar, high gel strength
GK9085-100G	Glentham Life Sciences	100 g	EUR 54

Agar, high gel strength
GK9085-1KG	Glentham Life Sciences	1 kg	EUR 174

Agar, high gel strength
GK9085-250G	Glentham Life Sciences	250 g	EUR 78

Agar, high gel strength
GK9085-500G	Glentham Life Sciences	500 g	EUR 112

Agar, low gel strength
GK2227-1KG	Glentham Life Sciences	1 kg	EUR 142

Agar, low gel strength
GK2227-500G	Glentham Life Sciences	500 g	EUR 94

Dried Aluminium Hydroxide Gel
GK2734-100G	Glentham Life Sciences	100 g	EUR 46

SensitiveSafe DNA Gel Stain
W139-500	101Bio	-	Ask for price

Agarose, Low melting gel
AB0015	Bio Basic	10g	EUR 80.45

Quick Gel Extraction Kit
20-abx098085	Abbexa	EUR 286.00 EUR 203.00	200 rxns 50 rxns

Gel casting stand L
2322111	Atto	5unit	EUR 257
Description: 1pc

Gel casting stand S
2322116	Atto	5unit	EUR 257
Description: 1pc

10x Gel Loading Buffer
TG4038	TopoGen	1ml	EUR 156

Anti-Flag Affinity Gel
B23101	Bimake	1 ml Kit	EUR 483
Description: Anti-Flag Affinity Gel is a Protein A purIFied murine IgG2b Monoclonal antibody covalently attached to sepharose 4B wHICh could used on Flag fusion protein purIFication, IP and CO-IP.

Anti-Flag Affinity Gel
B23102	Bimake	5 ml Kit	EUR 1452
Description: Anti-Flag Affinity Gel is a Protein A purIFied murine IgG2b Monoclonal antibody covalently attached to sepharose 4B wHICh could used on Flag fusion protein purIFication, IP and CO-IP.

Stop Solution, 25ML
X020-25ML	Arbor Assays	25ML	EUR 109

Stop Solution, 5ML
X020-5ML	Arbor Assays	5ML	EUR 65

Stop Solution, 1ML
X046-1ML	Arbor Assays	1ML	EUR 65

Creatinine Solution, 100ML
X116-100ML	Arbor Assays	100ML	EUR 131

Creatinine Solution, 25ML
X120-25ML	Arbor Assays	25ML	EUR 173

Extraction Solution, 250ML
X123-250ML	Arbor Assays	250ML	EUR 263

Extraction Solution, 50ML
X123-50ML	Arbor Assays	50ML	EUR 123

Mesotocin Solution, 625UL
X127-625UL	Arbor Assays	625UL	EUR 227

Isotocin Solution, 625UL
X128-625UL	Arbor Assays	625UL	EUR 227

Stop Solution, 5ML
X134-5ML	Arbor Assays	5ML	EUR 65

RNA Stabilization Solution
FARSS-001	Favorgen	100ml	EUR 208

Glutaraldehyde, 50% solution
G0875	Bio Basic	25ml	EUR 60.44

Glutaraldehyde, 25% solution
GC3870	Bio Basic	100ml	EUR 60.44

calibration solution ammonium
ISC20	Consort	ea	EUR 91

calibration solution bromide
ISC21	Consort	ea	EUR 91

calibration solution calcium
ISC23	Consort	ea	EUR 91

calibration solution chloride
ISC24	Consort	ea	EUR 91

calibration solution cupric
ISC25	Consort	ea	EUR 91

calibration solution fluoride
ISC27	Consort	ea	EUR 91

calibr. solution fluoroborate
ISC28	Consort	ea	EUR 91

calibration solution iodide
ISC29	Consort	ea	EUR 91

L’analyse de la génomique fonctionnelle a révélé que les gènes impliqués dans la production de lipides, les canaux ioniques et les antiporteurs sont développés et exprimés. L’exposition au stress thermique modifie le métabolisme des acides gras et augmente la synthèse des acides aminés. L’analyse de co-expression montre que de nombreux gènes de biosynthèse d’acides gras sont surexprimés avec des facteurs de transcription spécifiques sous stress froid. Ces gènes et d’autres impliqués dans la réponse métabolique et régulatrice au stress thermique peuvent être explorés plus avant pour l’amélioration de la souche.