L’oncialamycine (UCM) appartient à la sous-famille fusionnée à l’anthraquinone des produits naturels enediyne à 10 membres qui présente une cytotoxicité extraordinaire contre un large spectre de lignées cellulaires cancéreuses humaines. Les conjugués anticorps-médicament (ADC), utilisant des analogues synthétiques de l’UCM comme charge utile, sont en développement préclinique. L’UCM est exclusivement produit par Streptomyces uncialis DCA2648 sur milieu gélose solide à faibles titres (∼0,019 mg / L), limitant son apport par fermentation microbienne et entravant ses études de biosynthèse et d’ingénierie par la manipulation des voies in vivo.
Nous rapportons ici les conditions de culture qui permettent la manipulation génétique de la biosynthèse UCM in vivo et permettent la production d’UCM, avec des titres améliorés, par fermentation submergée des souches de S. uncialis modifiées. Ces résultats mettent en évidence une plate-forme biotechnologique pour la biosynthèse, l’ingénierie et la production d’UCM qui devrait faciliter à la fois ses études fondamentales et ses applications translationnelles.
Plus précisément, le titre d’UCM a été amélioré de près de 58 fois à ∼1,1 mg / L grâce à la combinaison de la suppression de grappes de gènes biosynthétiques codant pour des métabolites non liés du type sauvage de S. uncialis, la mutagenèse chimique et la manipulation de régulateurs spécifiques de la voie pour les souches de S. uncialis, et enfin l’optimisation moyenne de ces dernières pour la production d’UCM. La manipulation génétique de la biosynthèse de l’UCM a été démontrée en inactivant des gènes sélectionnés dans les souches modifiées de S. uncialis, dont l’une a donné une souche mutante accumulant la tiancimycine B, un intermédiaire biosynthétique commun connu pour la sous-famille de produits naturels d’énediyne fusionnés à l’anthraquinone.
Applications de la bioluminescence en biotechnologie et au-delà
La bioluminescence est le phénomène naturel fascinant par lequel les créatures vivantes produisent de la lumière. La bioluminescence se produit lorsque l’oxydation d’une luciférine à petite molécule est catalysée par une enzyme luciférase pour former une espèce à l’état excité qui émet de la lumière. Il existe plus de 30 systèmes bioluminescents connus, mais les paires luciférine-luciférase de seulement 11 systèmes ont été caractérisées à ce jour, tandis que d’autres nouveaux systèmes sont actuellement à l’étude. Les différentes paires luciférine-luciférase ont des longueurs d’onde d’émission de lumière différentes et sont donc adaptées à diverses applications.
La dernière décennie environ a vu de grands progrès dans l’ingénierie des protéines, la chimie synthétique et la physique qui ont permis aux luciférines et aux luciférases d’atteindre des applications jusqu’alors inexplorées. La réaction de bioluminescence est désormais couramment utilisée pour les dosages géniques, la détection des interactions protéine-protéine, le criblage à haut débit (HTS) dans la découverte de médicaments, le contrôle de l’hygiène, l’analyse de la pollution dans les écosystèmes et l’imagerie in vivo chez les petits mammifères. S’éloignant de la détection et de l’imagerie, les faits saillants les plus récents des applications de la bioluminescence en biomédecine comprennent le photodécage induit par la bioluminescence de petites molécules
la thérapie photodynamique basée sur la bioluminescence (PDT) et l’utilisation de la bioluminescence pour contrôler les neurones. Il y a également eu une augmentation de la recherche sur le ciel bleu telle que l’ingénierie de diverses usines émettrices de lumière. Cela a conduit à de nombreuses sciences multidisciplinaires passionnantes dans diverses disciplines. Cette revue se concentre sur les applications passées, présentes et futures de la bioluminescence. Nous visons à rendre cette revue accessible à tous les chimistes pour comprendre comment ces applications ont été développées et sur quoi elles reposent, en termes simples et compréhensibles pour un chimiste diplômé.
Les informations génomiques ont révélé que la capacité exceptionnelle de synthèse de produits naturels par A. terreus reste à explorer davantage. Avec les progrès de la stratégie d’extraction du génome, les produits de plusieurs grappes de gènes biosynthétiques cryptiques ont été découverts récemment. En outre, une série d’études d’ingénierie métabolique ont été réalisées dans les souches industrielles de lovastatine et d’acide itaconique pour améliorer encore les processus de production. Cette revue présente les progrès actuels et les perspectives d’avenir dans le domaine de la biotechnologie A. terreus.
Une caractérisation multi-omique du stress thermique dans une souche de Scenedesmus halotolérante pour la biotechnologie algale
Les microalgues convertissent efficacement la lumière du soleil en lipides et en glucides, offrant des alternatives biosourcées pour la production d’énergie et de produits chimiques. L’amélioration de la productivité et de la robustesse des algues contre le stress abiotique nécessite une caractérisation au niveau des systèmes permise par la génomique fonctionnelle. Ici, nous caractérisons une microalgue halotolérante Scenedesmus sp. NREL 46B-D3 démontrant un pic de croissance près de 25 ° C qui atteint 30 g / m2 / jour et la plus grande capacité d’accumulation de biomasse après la division cellulaire rapportée à ce jour pour une souche halotolérante.
) Finegel Stacking Gel Solution(5%) |
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| F1505-010 | GenDepot | 100ml | EUR 97 |
 SafePinky DNA Gel Staining Solution |
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| S1000-050 | GenDepot | 500ml | EUR 131 |
SafePinky DNA Gel Staining Solution |
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| S1000-100 | GenDepot | 2X500ml | EUR 188 |
SafePinky DNA Gel Staining Solution |
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| S1000-200 | GenDepot | 4X500ml | EUR 280 |
 T-Pro EZ Gel Solution 8% |
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| JB02-B008M | T-Pro Biotechnology | 500ml/BT | EUR 222 |
T-Pro EZ Gel Solution 8% |
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| JB02-B008S | T-Pro Biotechnology | 100ml/BT | EUR 135 |
 T-Pro EZ Gel Solution 10% |
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| JB02-B010M | T-Pro Biotechnology | 500ml/BT | EUR 222 |
T-Pro EZ Gel Solution 10% |
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| JB02-B010S | T-Pro Biotechnology | 100ml/BT | EUR 135 |
 T-Pro EZ Gel Solution 12% |
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| JB02-B012M | T-Pro Biotechnology | 500ml/BT | EUR 222 |
T-Pro EZ Gel Solution 12% |
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| JB02-B012S | T-Pro Biotechnology | 100ml/BT | EUR 135 |
 T-Pro EZ Gel Solution 15% |
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| JB02-B015M | T-Pro Biotechnology | 500ml/BT | EUR 222 |
T-Pro EZ Gel Solution 15% |
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| JB02-B015S | T-Pro Biotechnology | 100ml/BT | EUR 135 |
 T-Pro EZ stain Gel solution |
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| JT90-R005M | T-Pro Biotechnology | 500ml/BT | EUR 187 |
T-Pro EZ stain Gel solution |
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| JT90-R005S | T-Pro Biotechnology | 100ml/BT | EUR 126 |
 SDS-PAGE Resolving Gel Casting Solution |
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| P9050-050 | GenDepot | 500ml | EUR 88 |
SDS-PAGE Resolving Gel Casting Solution |
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| P9050-100 | GenDepot | 2X500ml | EUR 120 |
 SDS-PAGE Stacking Gel Casting Solution |
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| P9051-010 | GenDepot | 100ml | EUR 80 |
SDS-PAGE Stacking Gel Casting Solution |
|||
| P9051-050 | GenDepot | 500ml | EUR 112 |
 dsGreen Gel Staining Solution, 10000×, 1 mL |
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| 20010 | lumiprobe | 1 mL | EUR 134 |
 dsGreen Gel Staining Solution, 10000×, 0.5 mL |
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| 10010 | lumiprobe | 0.5 mL | EUR 89 |
) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(10%) |
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| F1500-100 | GenDepot | 2x500ml | EUR 188 |
) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(8%) |
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| F1501-100 | GenDepot | 2X500ml | EUR 188 |
) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(12.5%) |
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| F1502-100 | GenDepot | 2X500ml | EUR 188 |
) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(15%) |
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| F1503-100 | GenDepot | 2X500ml | EUR 188 |
 In Water) SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water |
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| S1001-025 | GenDepot | 250ul | EUR 161 |
SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water |
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| S1001-050 | GenDepot | 2x250ul | EUR 247 |
SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water |
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| S1001-100 | GenDepot | 1ml | EUR 435 |
SafePinky DNA Gel Staining Solution(10,000X) In Water |
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| S1001-500 | GenDepot | 5x1ml | EUR 1643 |
) Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x) |
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| S1002-001 | GenDepot | 1ml | EUR 111 |
Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x) |
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| S1002-005 | GenDepot | 5x1ml | EUR 226 |
Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x) |
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| S1002-010 | GenDepot | 10ml | EUR 300 |
Safe E-Red DNA Gel Staining Solution(1000x) |
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| S1002-020 | GenDepot | 20ml | EUR 496 |
 Conjugate Drying Buffer, 2 mL |
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| CDB-002 | BioAssayWorks | 2 mL | EUR 88.51 |
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|
Description: Conjugate Drying Buffer nables drying of gold conjugates on ribbon or conjugate pad suitable for lateral-flow assay. |
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 Cyber Orange™ Nucleic Acid Gel Stain *10,000X DMSO Solution* |
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| 17595 | AAT Bioquest | 1 ml | EUR 306 |
|
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 Gelite™ Red Nucleic Acid Gel Stain *10,000X DMSO Solution* |
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| 17600 | AAT Bioquest | 1 mL | EUR 176 |
|
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 Gelite™ Red Nucleic Acid Gel Stain *100X Water Solution* |
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| 17603 | AAT Bioquest | 10 mL | EUR 132 |
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, +500ml Finegel Buffer) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(10%), +500ml Finegel Buffer |
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| F1500-000 | GenDepot | 500ml | EUR 188 |
 + 500ml Finegel Buffer) Finegel SDS-PAGE Running Gel Solution(8%) + 500ml Finegel Buffer |
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| F1501-000 | GenDepot | 500ml | EUR 188 |
 Maximo-Gel juice fluorescent Protein-Gel Gel stain |
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| 310012 | GeneOn | 10 ml | EUR 185 |
Maximo-Gel juice fluorescent Protein-Gel Gel stain |
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| 310012-L | GeneOn | 10x10ml | EUR 1587 |
 Gel-Bright LED Gel Illuminator |
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| E90003 | Biotium | 1EA | EUR 773 |
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Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1EA |
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 Drying Box, 100 X 40 X 10mm |
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| DB031 | Bio Basic | 1 UNIT | EUR 76.1 |
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 Gel-FAST? Gel Staining/Destaining Kit |
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| K901-40 | Biovision | EUR 175 | |
 Gel Tray |
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| 2394250 | Atto | 4unit | EUR 270 |
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Description: I ncl udi ng pl at es |
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Gel Tray |
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| 2398194 | Atto | 2unit | EUR 354 |
 TC Gel |
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| CP048-005 | GenDepot | 500 g | EUR 232 |
TC Gel |
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| CP048-010 | GenDepot | 1 Kg | EUR 347 |
 Gel Cutter |
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| KS071012-11 | Biochain | 12 | EUR 89 |
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Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol. |
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 Gel Filter |
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| KS071012-13 | Biochain | 12 | EUR 115 |
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Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol. |
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 Gel tray L |
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| 2322112 | Atto | 5unit | EUR 257 |
|
Description: 2pcs/1set |
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 Gel tray S |
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| 2322117 | Atto | 5unit | EUR 257 |
|
Description: 2pcs/1set |
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 AGAR, HIGH GEL |
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| A01-102IHG-10kg | Alphabiosciences | 10 kg | EUR 2219 |
AGAR, HIGH GEL |
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| A01-102IHG-2Kg | Alphabiosciences | 2 Kg | EUR 521 |
AGAR, HIGH GEL |
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| A01-102IHG-500g | Alphabiosciences | 500 g | EUR 178 |
) Ketanserin (Vulketan Gel) |
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| E1KS2232 | EnoGene | 50mg | EUR 434 |
 Gel Breaker Tubes |
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| KS071012-12 | Biochain | 12 | EUR 89 |
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Description: Premade ready to use kits will always come in handy. Get your experiment done right form the first try by using a validated kit with perfectly balanced reagents proportions and compatibility and by following a clear protocol. |
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 ViSafe RED Gel |
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| S430 | GeneOn | 500 µl | EUR 146 |
ViSafe RED Gel |
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| S430L | GeneOn | 5x500 µl | EUR 557 |
 ViSafe Green Gel |
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| S435 | GeneOn | 500 µl | EUR 146 |
ViSafe Green Gel |
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| S435L | GeneOn | 5x500 µl | EUR 557 |
 Aluminium Phosphate Gel |
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| VAdv-Ly0001 | Creative Biolabs | 250 mL | EUR 1386 |
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Description: Aluminium Phosphate Gel 2%, Aluminum salt Vaccine adjuvant. |
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 Aluminium Hydroxide Gel |
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| VAdv-Ly0003 | Creative Biolabs | 250 mL | EUR 1386 |
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Description: Aluminium Hydroxide Gel 2%, Aluminum salt Vaccine adjuvant. |
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 Sodium Pyruvate Solution, 100 mM Solution |
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| CCM1753-100 | Bio Basic | 100 mL | EUR 60.84 |
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 SDS Solution |
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| 2102-100 | Biovision | EUR 137 | |
 EDTA Solution |
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| 2103-100 | Biovision | EUR 137 | |
 TRIMMING SOLUTION |
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| 99-676-CM | CORNING | 1 L /pk | EUR 88 |
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Description: Specialty Media; Islet products |
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 AlphaBioCoat Solution |
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| AC001 | Neuromics | 20 ml | EUR 271 |
 Borax Solution |
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| BOR015 | ScyTek Laboratories | 15 ml | EUR 56 |
Borax Solution |
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| BOR125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 79 |
Borax Solution |
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| BOR500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 119 |
Borax Solution |
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| BOR999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 183 |
 Stop Solution |
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| F006 | Cygnus Technologies | 12 ml | EUR 180 |
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Description: Stop Solution by Cygnus Technologies is available in Europe via Gentaur. |
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 Prehybridization Solution |
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| K2191050-1 | Biochain | 5 ml | EUR 137 |
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Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation. |
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 Hybridization Solution |
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| K2191050-2 | Biochain | 5 ml | EUR 157 |
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Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation. |
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 Blocking Solution |
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| K2191050-8 | Biochain | 250 ul | EUR 137 |
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Description: Can be used for various proteomics studies in both normal and pathological cases. It is an excellent control and suitable for educational purposes. This product is prepared from whole tissue homogenates and has undergone SDS-PAGE quality control analysis. The protein is stored in a buffer with protease inhibitor cocktail fo prevent degradation. |
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 Orcein Solution |
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| OAA125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 66 |
Orcein Solution |
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| OAA500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 109 |
Orcein Solution |
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| OAA999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 148 |
 Methenamine Solution |
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| MET125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 64 |
Methenamine Solution |
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| MET500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 95 |
Methenamine Solution |
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| MET999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 132 |
 DTT Solution |
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| R-1104 | EpiGentek | 1 ml, 500 mM | EUR 109.45 |
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Description: fast delivery possible |
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 Tartrazine Solution |
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| TZQ125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 64 |
Tartrazine Solution |
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| TZQ500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 98 |
Tartrazine Solution |
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| TZQ999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 127 |
 Schiff's Solution |
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| SRF030 | ScyTek Laboratories | 30 ml | EUR 64 |
Schiff's Solution |
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| SRF250 | ScyTek Laboratories | 250 ml | EUR 77 |
Schiff's Solution |
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| SRF3800 | ScyTek Laboratories | 1 Gal. | EUR 345 |
Schiff's Solution |
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| SRF500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 103 |
Schiff's Solution |
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| SRF999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 149 |
 Denaturing solution |
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| DE540 | Bio Basic | 1L | EUR 61.31 |
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 Gentamicin Solution, Gentamicin Solution, 50 mg/mL |
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| CCM1123-010 | Bio Basic | 10 mL | EUR 64.05 |
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 Gel casting stand L |
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| 2322111 | Atto | 5unit | EUR 257 |
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Description: 1pc |
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 Gel casting stand S |
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| 2322116 | Atto | 5unit | EUR 257 |
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Description: 1pc |
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 Anti-Flag Affinity Gel |
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| B23101 | Bimake | 1 ml Kit | EUR 483 |
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Description: Anti-Flag Affinity Gel is a Protein A purIFied murine IgG2b Monoclonal antibody covalently attached to sepharose 4B wHICh could used on Flag fusion protein purIFication, IP and CO-IP. |
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Anti-Flag Affinity Gel |
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| B23102 | Bimake | 5 ml Kit | EUR 1452 |
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Description: Anti-Flag Affinity Gel is a Protein A purIFied murine IgG2b Monoclonal antibody covalently attached to sepharose 4B wHICh could used on Flag fusion protein purIFication, IP and CO-IP. |
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 Quick Gel Extraction Kit |
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| 20-abx098085 | Abbexa |
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 dam for 20cm gel |
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| EHS3500-DAM | Consort | ea | EUR 166 |
 dam for 23.5cm gel |
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| EHS3600-DAM | Consort | ea | EUR 166 |
 dam for 15cm gel |
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| EHS3400-DAM | Consort | ea | EUR 158 |
) AmbiClean Kit (PCR & Gel) |
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| GV05 | GeneOn | 5 preps | Ask for price |
AmbiClean Kit (PCR & Gel) |
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| GV100 | GeneOn | 100 preps | EUR 128 |
AmbiClean Kit (PCR & Gel) |
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| GV200 | GeneOn | 200 preps | EUR 189 |
AmbiClean Kit (PCR & Gel) |
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| GV50 | GeneOn | 50 preps | EUR 91 |
 mini tube gel insert |
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| EVS1100-TUBEINSERT | Consort | ea | EUR 411 |
 maxi tube gel insert |
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| EVS1300-TUBEINSERT | Consort | ea | EUR 504 |
 Agar, high gel strength |
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| GK9085-100G | Glentham Life Sciences | 100 g | EUR 54 |
Agar, high gel strength |
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| GK9085-1KG | Glentham Life Sciences | 1 kg | EUR 174 |
Agar, high gel strength |
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| GK9085-250G | Glentham Life Sciences | 250 g | EUR 78 |
Agar, high gel strength |
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| GK9085-500G | Glentham Life Sciences | 500 g | EUR 112 |
 Gel DNA Recovery Kit |
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| GP05 | GeneOn | 5 preps | Ask for price |
Gel DNA Recovery Kit |
|||
| GP100 | GeneOn | 100 preps | EUR 130 |
Gel DNA Recovery Kit |
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| GP200 | GeneOn | 200 preps | EUR 189 |
Gel DNA Recovery Kit |
|||
| GP50 | GeneOn | 50 preps | EUR 94 |
 Agar, low gel strength |
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| GK2227-100G | Glentham Life Sciences | 100 g | EUR 50 |
Agar, low gel strength |
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| GK2227-1KG | Glentham Life Sciences | 1 kg | EUR 142 |
Agar, low gel strength |
|||
| GK2227-250G | Glentham Life Sciences | 250 g | EUR 66 |
Agar, low gel strength |
|||
| GK2227-500G | Glentham Life Sciences | 500 g | EUR 94 |
 Dried Aluminium Hydroxide Gel |
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| GK2734-100G | Glentham Life Sciences | 100 g | EUR 46 |
 10x Gel Loading Buffer |
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| TG4038 | TopoGen | 1ml | EUR 156 |
 SensitiveSafe DNA Gel Stain |
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| W139-500 | 101Bio | NULL | EUR 0 |
 Agarose, Low melting gel |
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| AB0015 | Bio Basic | 10g | EUR 80.45 |
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 Cyber Green™ Nucleic Acid Gel Stain [Equivalent to SYBR® Green] *10,000X DMSO Solution* |
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| 17590 | AAT Bioquest | 1 ml | EUR 219 |
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 HYGROMYCIN B SOLUTION |
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| 30-240-CR | CORNING | 20 mL/pk | EUR 157 |
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Description: Media Catalog; Cell Culture Reagents |
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 Ponceau S Solution |
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| 22001 | Biotium | 1L | EUR 125 |
|
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1L |
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) HEPES SOLUTION (1M) |
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| 25-060-CI | CORNING | 100 mL/pk | EUR 104 |
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Description: Media Catalog; Cell Culture Reagents |
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 Acrylamide Solution 30% |
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| A067-1L | TOKU-E | 1 L | EUR 103 |
Acrylamide Solution 30% |
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| A067-500Ml | TOKU-E | 500 ml | EUR 71 |
 Ringer Solution Tablets |
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| 09-1025-100 | Medicago | 100 tablets | EUR 70 |
 PROTEINASE K SOLUTION |
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| 501-PK | Viagen | 5 ml | EUR 152 |
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Description: Genomic PCR Grade Proteinase K Solution |
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 CometAssay Lysis Solution |
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| 4250-010-01 | Biotechne | 100 mL | EUR 157.8 |
 Alcian Yellow Solution |
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| ANY125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 83 |
Alcian Yellow Solution |
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| ANY3800 | ScyTek Laboratories | 1 Gal. | EUR 454 |
Alcian Yellow Solution |
|||
| ANY500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 123 |
Alcian Yellow Solution |
|||
| ANY999 | ScyTek Laboratories | 1000 ml | EUR 178 |
 solution) Tyloxapol (10% ) solution |
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| B1159-250 | Biovision | EUR 512 | |
Tyloxapol (10% ) solution |
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| B1159-50 | Biovision | EUR 175 | |
 Hematoxylin Counterstain Solution |
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| AR0005 | BosterBio | 12mL(for 120-180 assays) | EUR 65 |
 Ponceau S solution |
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| AR0142 | BosterBio | 12mL(10X) | EUR 60 |
 Astra Blue Solution |
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| AST125 | ScyTek Laboratories | 125 ml | EUR 104 |
Astra Blue Solution |
|||
| AST500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 183 |
 DAB Differentiating Solution |
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| DDS500 | ScyTek Laboratories | 500 ml | EUR 109 |
L’analyse de la génomique fonctionnelle a révélé que les gènes impliqués dans la production de lipides, les canaux ioniques et les antiporteurs sont développés et exprimés. L’exposition au stress thermique modifie le métabolisme des acides gras et augmente la synthèse des acides aminés. L’analyse de co-expression montre que de nombreux gènes de biosynthèse d’acides gras sont surexprimés avec des facteurs de transcription spécifiques sous stress froid. Ces gènes et d’autres impliqués dans la réponse métabolique et régulatrice au stress thermique peuvent être explorés plus avant pour l’amélioration de la souche.